یکی از گرههای پیچیده در مدیریت آب، تعارض منافع ملی و محلی است. پروژههای انتقال بینحوضهای آب، درحالیکه در سطح ملی با هدف تامین آب شرب شهرهای بزرگ یا مراکز صنعتی تعریف میشوند، گاه در سطح محلی با مقاومت مردم روبهرو میشوند. این مقاومتها اغلب از احساس ناعادلانه بودن تقسیم منابع، نادیدهگرفتن سابقه تاریخی جوامع محلی در استفاده از منابع طبیعی و فقدان مشارکت اجتماعی در طراحی و اجرای پروژهها نشأت میگیرد.