شریفی در همه سالهای شهرداری قالیباف در حالی عنوان قائممقامی را یدک میکشید که به گفته ابراهیم شیخ، معاون وقت منابع انسانی کنونی شهردار تهران، در این سالها هیچگاه سمتی در ساختار شهرداری بهعنوان قائممقام نداشتهایم و برای عیسی شریفی تنها سمت معاون هماهنگی امور مناطق ثبت شده است. ضمن اینکه این فرد در تمام این مدت از مجموعهای نظامی به شهرداری تهران مأمور بوده و در تمام این سالها حقوقی دریافت نمیکرده است.