میکروبیوم تحت تاثیر رژیم غذایی، داروها، سیگار کشیدن، ورزش بدنی و بیماریها قرار میگیرد. برای مثال، استفاده از آنتی بیوتیکها در اوایل دوران کودکی میتواند یک عامل خطر باشد که تعادل میکروبی را تغییر میدهد. بهایی که ما باید برای نمردن بر اثر عفونت بپردازیم این است که بیماریهای ناشی از سیستم ایمنی میتوانند ظهور کنند.